A Estomatologia é área responsável pelo ensino do diagnóstico oral aos alunos de graduação e pós-graduação, os quais participam da Clínica de Estomatologia, onde experimentam a oportunidade de aprender Estomatologia, realizando exame clínico, biópsia, diagnóstico e tratamento de pacientes com doenças da boca. Além disso, a área fornece ensino e assistência sobre cuidados odontológicos para pacientes com a saúde comprometida por doenças sistêmicas, atendidos no Serviço de Odontologia Clínica do Hospital Universitário Clementino Fraga Filho (HUCFF-UFRJ).

É a área da Odontologia responsável pelo ensino da radiologia e imaginologia oral aos estudantes de graduação e pós-graduação, além de oferecer através da Clínica de Radiologia Oral, diferentes exames de imagem incluindo tomografia computadorizada por feixe cônico, aos pacientes da Faculdade de Odontologia e externos.

É a área da Odontologia responsável pelo ensino da patologia oral e maxilofacial aos estudantes de graduação e pós-graduação de Odontologia, além de fornecer o serviço de diagnóstico histopatológico do Laboratório de Patologia Oral às comunidades acadêmica e profissional de diversos centros odontológicos públicos e privados do país.